Transferibilidade de locos microssatélites desenvolvidos em outras espécies de palmeiras para Astrocaryum vulgare Mart.
Abstract
Astrocaryum vulgare Mart., conhecida por tucumã-do-Pará, possui uso popular na região amazônica e grandes potencialidades de aproveitamento em indústrias farmacêutica, cosmética e de biodiesel. A exploração ainda é extrativista, tornando fundamentais informações sobre a variabilidade genética existente em áreas de ocorrência natural. A variabilidade genética pode ser acessada por marcadores microssatélites ou SSR, considerados ideais para estudo em populações naturais. Entretanto, não há relatos de desenvolvimento de microssatélites para A. vulgare. O objetivo foi avaliar a transferibilidade de locos SSR desenvolvidos para outras espécies de palmeiras em A. vulgare. Realizou-se a extração de DNA a partir de amostras de folíolos de tucumanzeiros de sete povoamentos e após a quantificação os DNA’s foram submetidos à PCR, com os locos desenvolvidos para Bactris gasipaes, Phoenix dactylifera e Astrocaryum aculeatum. As condições de amplificação seguiram o protocolo desenvolvido para A. aculeatum, com pequenas adaptações. Os produtos amplificados foram aplicados em gel de agarose a 3,5%, corado com brometo de etídio e submetidos à eletroforese horizontal. Os perfis dos géis foram fotodocumentados e as imagens armazenadas digitalmente. A transferibilidade dos locos foi avaliada com base na amplificação dos produtos, sua nitidez e ausência de bandas inespecíficas. Todos os locos de A. aculeatum e a maioria dos de B. gasipaes amplificaram, com 75% deles transferíveis para o genoma de A. vulgare, enquanto que apenas dois dos locos de P. dactylifera amplificaram, com muitas bandas inespecíficas, mostrando-se inviáveis para estudos do genoma da espécie.
Downloads
References
ALVES, R. M.; SEBBENN, A. M.; ARTERO, A. S.; FIGUEIRA, A. Microsatellite loci transferability from Theobroma cacao to Theobroma grandiflorum. Molecular Ecology Notes, Malden, v.6, p. 1219-1221. 2006.
BILLOTE, N.; COUVREUR, T.; MARSEILLAC, N.; BROTTIER, P.; PERTHUIS, B.; VALLEJO, M.; NOYER, J-L.; JACQUEMOUD-COLLET, J-P.; RISTERUCCI, A-M.; PINTAUD, J-C. A new set of microsatellite markers for the peach palm (Bactris gasipaes Kunth); characterization and across-taxa utility within the tribe Cocoeae. Molecular Ecology Notes, n.4, p. 580-582, 2004a.
BILLOTTE, N.; MARSEILLAC, N.; BROTTIER, P.; NOYER, J-L.; JACQUEMOUD-COLLET, J-P.; MOREAU, C.; COUVREUR, T.; CHEVALLIER, M-H.; PINTAUD, J-C.; RISTERUCCI, A-M. Nuclear microsatellite markers for the date palm (Phoenix dactylifera L.): characterization and utility across the genus Phoenix and in other palm genera. Molecular Ecology Notes, n. 4., p. 256 –258, 2004b.
BORÉM, A. Considerações sobre o fluxo gênico. Biotecnologia, Ciência & Desenvolvimento, n.34, 2005.
COSTA, M. R.; OLIVEIRA, M. DO S. P. Extração de DNA de açaizeiro a partir de folhas. Embrapa Amazônia Oriental. Documentos, 127. 2002.
CLEMENT, C. R.; LLERAS PÉREZ, E.; VAN LEEUWEN, J. O potencial das palmeiras tropicais no Brasil: acertos e fracassos das últimas décadas. Agrociências, Montevidéu. v. 9, n.1-2, p. 67-71. 2005.
CYMERYS, M. Tucumã-do-Pará (Astrocaryum vulgare Mart.). In: SHANLEY, P.; MEDINA, G. Frutíferas e Plantas Úteis na Vida Amazônica. Belém: CIFOR, Imazon, 2005. p. 209-214.
DOYLE, J.J.; DOYLE, J.L. Isolation of plant DNA from fresh tissue. Focus, v.12, p 13-15,1990.
GAIOTTO, F. A.; BRONDANI, R.P.V.; GRATTAPAGLIA, D. Microsatellite markers for heart of palm – Euterpe edulis and E. oleracea Mart. (Palmae). Molecular Ecology Notes, Oxford, v. 1, n. 1/2, p. 86-88, Mar/June, 2001.
GONÇALVES, F.K.; FÁVERO, T.M.; PINTO, L.R. Avaliação de transferibilidade de microssatélites funcionais de sorgo (EST-SSR) visando a construção de mapas de ligação em cana-de-açúcar. In: CONGRESSO INTERINSTITUCIONAL DE INICIAÇÃO CIENTÍFICA- CIIC,5, 2011. Anais... Campinas, SP: Embrapa Monitoramento por Satélite, 2011.
HAYNES, J.; MCLAUGHLIN, J. Edible Palms and Their Uses. Florida Cooperative Extension Service. Institute of Food and Agricultural Sciences. University of Florida. 2000.
MAMBRIM, M.C.T; ARELLANO, D.B. Caracterización de aceites de frutos de palmeras de la región amazónica del Brasil. Grasas y Aceites, v. 48, n.3, 1997, p. 154-158.
MILACH, S. C. K. Marcadores de DNA. Biotecnologia Ciência e Desenvolvimento, v., p. 14-17, 1998.
MISTURA, C. C.; BARBIERI, R. L.; CASTRO, C. M.; PRIORI, D.; VILLELA, J. C. B. Transferibilidade de marcadores microssatélites de coco (Cocos nucifera) para butiá (Butia odorata). Magistra. v. 24, n. 4, p. 360-369. 2012.
NASS, L.L. Recursos genéticos vegetais. Brasília, Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, 2007.
NAZARENO, A.G.; ZUCCHI, M.I.; REIS, M.S. Microsatellite markers for Butia eriospatha (Arecaceae), a vulnerable palm species from the Atlantic Rainforest of Brasil. American Journal of Botany, Saint Louis, v.98, n.7, p.198-200, 2011.
OLIVEIRA, L. de S.; ASSIS, J. S. de. Caracterização físico-química dos frutos de três variedades de tamareiras (Phoenix dactylifera L.) introduzidas no BAG da Embrapa Semi-Árido. In: QUEIRÓZ, M. A. de.; GOEDERT, C. O.; RAMOS, S. R. R. In: Recursos genéticos e melhoramento de plantas para o nordeste brasileiro. Petrolina-PE: Embrapa Semi-Árido / Brasília-DF: Embrapa Recursos Genéticos e Biotecnologia, nov. 1999. Disponível em: <http://www.cpatsa.embrapa.br.> Acesso em: 20 janeiro 2014.
OLIVEIRA, M. do S. P. de; RIOS, S. de A. Potencial econômico de algumas palmeiras nativas da Amazônia. In: ENCONTRO AMAZÔNICO DE AGRÁRIAS-ENAAG, 6, 2014, Belém. Anais...,. Belém: UFRA, 2014.
PEREIRA, A. A.; CLEMENT, C.R.; RODRIGUES, D.P. Transferibilidade de locos microssatélites de pupunha (Bactris gasipaes) e côco (Cocos nucifera) para buriti (Mauritia flexuosa). In: REUNIÃO ANUAL DA SBPC, 61. 2009, Manaus. Anais...,. Manaus: UFAM, 2009.
PINTO, M. F. F. C. Caracterização de locos microssatélites em duas espécies de abelhas da região amazônica: Melipona compressipes e Melipona seminigra (Hymenoptera: Apidae: Meliponina). 2007. 66 f. Dissertação (Mestrado em Biologia Tropical e Recursos Naturais)- Universidade Federal do Amazonas (UFAM), Manaus. 2007.
RAMOS, S. L. F.; LOPES, M.T.G.; LOPES, R; CUNHA, R.N.V.; MACEDO, J.L.V; CONTIM, L.A.S.; CLEMENT, C.R.; RODRIGUES, D. P; BERNARDES, L.G. Determination of the mating system of Tucumã palm using microsatellite markers. Crop Breed. Appl. Biotechnol. [online]. 2011, vol.11, n.2, pp. 181-185. ISSN 1984-7033.
RAMOS, S. L. F.; MACÊDO, J. L. V. DE; LOPES, M. T. G.; BATISTA, J. S.; FORMIGA, K. M.; SILVA, P. P. DA; SAULO-MACHADO, A. C.; VEASEY, E. A. Microsatellite loci for tucumã of amazonas (Astrocaryum aculeatum) and amplification in other Arecaceae. American Journal of Botany, e508-e510,2012.http://www.amjbot.org/
RONCAL, J.; KAHN, F.; MILLAN, B.; COUVREUR, T. L. P.; PINTAUD, J. Cenozoic colonization and diversification patterns of tropical American palms: evidence from Astrocaryum (Arecaceae). Botanical Journal of the Linnean Society, 2013, v. 171, p. 120–139.
SANCHES, E. N. M.; OLIVEIRA, M. S. P. Transferibilidade de locos microssatélites de Bactris gasipaes para Astrocaryum aculeatum. In: CONGRESSO BRASILEIRO DE MELHORAMENTO DE PLANTAS, 7., 2013, Uberlândia. Anais...,. Viçosa, Minas Gerais: SBMP, 2013. p. 3291-3294.
SCHIAVON, A.L.; SANTOS, M.A.; SOUZA, R.C.; HUNGRIA, M. Transferibilidade de marcadores microssatélites de soja para feijão comum (Phaseolus vulgaris). In: JORNADA ACADÊMICA DA EMBRAPA SOJA, 4, 2009, Londrina. Anais...,. Londrina: Embrapa Soja, 2009.
UHL, N. W.; DRANSFIELD, J. Genera Palmarum. Allen Press, Lawrence, 1987. 610 p.
Authors retain copyright and grant the Journal the right to the first publication. Authors are encouraged to and may self-archive a created version of their article in their institutional repository, or as a book chapter, as long as acknowledgement is given to the original source of publication. As the Journal provides open access to its publications, articles may not be used for commercial purposes. The contents published are the sole and exclusive responsibility of their authors; however, the publishers can make textual adjustments, adaptation to publishing standards and adjustments of spelling and grammar, to maintain the standard patterns of the language and the journal. Failure to comply with this commitment will submit the offenders to sanctions and penalties under the Brazilian legislation (Law of Copyright Protection; nº 9,610; 19 February 1998).