Transferability of microsatellite markers to wild passion fruit species

Keywords: Plant breeding, Simple sequence repeats, Amplification, Polymorphism

Abstract

Molecular markers are tools that allow the monitoring of a breeding program progress. SSR (simple sequence repeats) markers are applied for genetic mapping studies, variability, assisted selection, crossing and backcrossing, because they are codominant, multiallelic and high polymorphic. However, the use of this type of molecular marker is limited, since primers are only available for commercially expressed species. Therefore, this work aimed to evaluate the transferability designed primers of Passiflora alata e Passiflora edulis to four wild species of Passiflora. The species used were: P. cincinnata, P. quadrangularis, P. mucronata and P. nitida. DNA extraction was done through the Promega Wizard® Kit. The amplification protocol used was the one proposed for P. alata and P. edulis with adaptations. Nineteen microsatellites designed for P. edulis and two designed for a genus P. alata were used. The amplicons were taken to horizontal electrophoresis in a 3% agarose gel, followed by staining with Nancy 520 buffer and the revelation was developed in a digital photodocumentator with UV light. The transferability was verified through the evaluation of band presence or absence. The microsatellites loci designed for P. edulis and P. alata were transferable for the examination of at least one species with high variable rate: P. quadrangularis (23.81%), P. cincinnata (33.33%), P. quadrangularis (23.81%), P. mucronata (19.05%) and P. nitida (14.28%). Markers PE13 and PE54 can be selected for molecular characterization studies because they are the only ones able to amplify all the wild passion fruit species tested.

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Author Biographies

Lucas Pereira da Silva, Universidade do Estado de Mato Grosso – Unemat

Possui formação Técnica em Informática pela Escola Estadual Padre Tiago (2013), graduação em Bacharelado em Agronomia pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2018) onde foi bolsista de Iniciação Científica (Pibic/CNPq/2015/2016),(Pibic/CNPq/2016/2017) e (Pibic/CNPq/2017/2018). Possui experiência na área de Melhoramento Genético, visando a resistência à doenças nos cultivos de Capsicum e Passiflora.

Thalita Neves Marostega, Universidade do Estado de Mato Grosso – Unemat

Possui formação Técnica em Agropecuária pela Escola Agrotécnica Federal de Cáceres (2007), graduação em Ciências Biológicas pela Universidade do Estado de Mato Grosso (2012), mestrado em Genética e Melhoramento de Plantas pela Universidade do Estado de Mato Grosso ( 2014). Tem experiencias nas áreas de diversidade genética e tecnologia de sementes. Atualmente trabalha com extensão rural e agroecologia.

Thiago Alexandre Santana Gilio, Universidade do Estado de Mato Grosso – Unemat

Thiago Alexandre Santana Gilio possui doutorado pelo Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento da Universidade Estadual de Maringá. Realizou o doutorado sanduíche no Soybean Genomic and Improvement Lab, ARS-USDA, Beltsville, MD, USA, sob orientação do PhD Macial Antonio Pastor-Corrales. Possui mestrado em genética e melhoramento de plantas pela Universidade do Estado do Mato Grosso, graduação em agronomia pelo Centro Universitário de Adamantina e formação em Técnico em Agricultura pela Fundação Shunji Nishimura de Tecnologia (FSNT-CTA). Atua na área de Melhoramento Genético vegetal com ênfase no uso e desenvolvimento de marcadores genéticos SSRs e SNPs, melhoramento do feijão comum e melhoramento visando resistência, Possui experiência nas culturas do algodão, feijão e cana de açúcar.Conquistou neste ano de 2017 o prêmio Jovem Melhorista - doutorado, SBMP. Participa como membro dos grupos de pesquisa cadastrados no CNPq: Melhoramento Genético Vegetal e Biotecnologia: Cordenado Pela Profª Drª Maria Celeste Gonçalves Vidigal e NÚCLEO DE PESQUISA APLICADA A AGRICULTURA: Cordenado Pelo Prof. Dr. Pedro Soares Vidigal Filho.

Milson Evaldo Serafim, Instituto Federal de Educação, Ciência e Tecnologia de Mato Grosso – IFMT

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Mato Grosso do Sul (2004), mestrado em Mestrado em Agronomia pela Universidade Federal da Grande Dourados (2007) e doutorado em Ciência do Solo pela Universidade Federal de Lavras (2011), área de concentração Recursos Ambientais e Uso da Terra. Atualmente é professor do Instituto Federal de Mato Grosso, Campus Cáceres-Prof. Olegario Baldo. Em 2017 iniciou o pós-doutorado no The Ohio State University Carbon Management and Sequestration Center (C-MASC), com previsão de encerramento em Setembro de 2018. Tem experiência na área de Agronomia, atuando principalmente nos seguintes temas: disponibilidade hídrica, sistemas conservacionistas de manejo do solo e da água, fertilidade do solo e nutrição de espécies florestais.

Kelly Lana Araújo, Universidade do Estado de Mato Grosso – Unemat

Possui graduação em Agronomia pela Universidade Federal de Viçosa (2003), Mestrado em Agronomia (Fitopatologia) pela Universidade Federal de Viçosa (2005), Doutorado em Produção Vegetal pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (2009) e Pós-doutorado pela Universidade Estadual de Londrina. Atualmente é professora efetiva da Universidade do Estado de Mato Grosso. Atua na área de Fitopatologia, principalmente com Epidemiologia e Manejo Integrado de Doenças de plantas.

Leonarda Grillo Neves, Universidade do Estado de Mato Grosso – Unemat

Nasceu no Rio de Janeiro, graduou-se em Agronomia pela Universidade Estadual do Norte Fluminense Darcy Ribeiro (1998), mestrado em Produção Vegetal pela Universidade Estadual do Norte Fluminense (2001) e doutorado em Genética e Melhoramento pela Universidade Federal de Viçosa (UFV). No período de 2016 a 2017 realizou o pos doutoramento em Melhoramento de fruteiras pela UFV. Possui experiência em atividades de ensino, pesquisa, extensão e administração universitária como professora da UNEMAT. É coordenadora de disciplinas na graduação e na pós-graduação, estando vinculada ao Programa de Pós-Graduação em Genética e Melhoramento de Plantas da UNEMAT, e também no Programa de Pós-Graduação em Biotecnologia e Biodiversidade, ambos credenciados pela CAPES (nível 4). Atua como consultora ad hoc para agências de fomento e periódicos nacionais. É líder de grupo de pesquisa do CNPq na área de Melhoramento de Plantas. Atua como consultora ad hoc para agências de fomento e periódicos nacionais. Coordenou e é membro de REDE de pesquisa no tema "Identificação de tecnologias sustentáveis de produção de fruteiras e geração de informação conforme diagnósticos dos potenciais agrícolas". Foi assessora da Pró-Reitoria de Pesquisa e Pós-Graduação, Coordenadora do curso de agronomia e da Comissão administrativa ética da UNEMAT. Atua principalmente nas áreas de Melhoramento de olerícolas e fruteiras, Resistência de Plantas a Doenças e Interação Planta-Patógeno e modelos biométricos.

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Published
2019-03-13
Section
Scientific Articles