Genetic diversity of sacha inchi accessions detected by AFLP molecular markers

  • Haroldo Silva Rodrigues Universidade Federal de Viçosa
  • Aluizio Borem Universidade Federal de Viçosa
  • Maria Teresa Gomes Lopes Universidade Federal do Amazonas
  • Cosme Damião Cruz Universidade Federal de Viçosa
  • Francisco Célio Maia Chaves Embrapa Amazônia Ocidental
  • Jânia Lília da Silva Bentes Universidade Federal do Amazonas

Resumo

 

 Sacha inchi (Plukenetia volubilis L.) is a species native to the Amazon region for which studies of genetic diversity are required to ensure the success in programs to breed cultivars for agriculture. The purpose of this study was to assess the genetic diversity among sacha inchi accessions using amplified fragment length polymorphism (AFLP) markers. Thirty-seven accessions of the sacha inchi germplasm bank of Embrapa Amazônia Ocidental were analyzed. The markers were identified with four primer combinations. The percentage of polymorphic loci was estimated and the similarity of accessions analyzed by calculating the arithmetic complement of the Jaccard coefficient and cluster analysis. The primers revealed 191 polymorphic loci. The parameters of the similarity values in class intervals were on average 0.739 and variance 0.01. The estimates of the number and percentage of the genetic distance values per class interval were highest in the range of 0.7 to 0.79, (248 and 37.24%, respectively); the highest percentage, 69.22%, corresponded to values of genetic distance above 0.7, showing mostly high genetic diversity among the accessions. The results indicated a geographic structure among accessions in relation to their origin, generating consistent and valuable data for breeding programs and species conservation.

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Referências

COLOMBO, C.; SECOND, G.; CHARRIER A. Diversity within American cassava germplasm based on RAPD markers. Genetics and Molecular Biology, v. 23, n. 1, p. 189-199, 2000.

COSTA, M. D.; PEREIRA W. E.; BRUNO R. L. A.; FREIRE E. C.; NÓBREGA M. D. M.; MILANI M.; OLIVEIRA A. D. Divergência genética entre acessos e cultivares de mamoneira por meio de estatística multivariada. Pesquisa Agropecuária Brasileira, v. 41, n. 11, p. 1617-1622, 2006.

COSTA, M. R.; CARDOSO, E. R.; OHAZE, M. M. M. Similaridade genética de cultivares de mandioca (Manihot esculenta) por meio de marcadores RAPD. Ciência e Agrotecnologia, v.27, n. 1, p. 158-164, 2003.

CRESTE, S.; TULMANN, N.A.; FIGUEIRA, A. Detection of single sequence repeat polymorphisms in denaturing polyacrilamide sequencing gels by silver staining. Plant Molecular Biology Reporter, v. 19, n. 4, p. 299-306, 2001.

CRUZ, C. D. GENES - a software package for analysis in experimental statistics and quantitative genetics. Acta Scientiarum, v. 35, n. 3, p. 271-276, 2013.

CRUZ, C. D.; FERREIRA, F. M.; PESSONI, L. A. (2011) Biometria aplicada ao estudo da diversidade genética. Visconde do Rio Branco: Editora Suprema, 2011. 620 p.

DOYLE, J. J.; DOYLE, J. L. A rapid DNA isolation procedure from small quantities of fresh leaf tissues. Phytochemical Bulletin, v. 19, n. 1, p. 11-15, 1987.

FERREIRA, M. E.; GRATTAPAGLIA, D. Introdução ao uso de marcadores moleculares em análise genética. Brasília: Embrapa/Cenargen, 1998, 222p.

FOLLEGATTI-ROMERO, L. A.; PIANTINO, C. R.; GRIMALDI, R.; CABRAL, F. A. Supercritical CO2 extraction of omega-3 rich oil from Sacha inchi (Plukenetia volubilis L.) seeds. The Journal of Supercritical Fluids, v. 49, n. 3, p. 323-329, 2009.

GANGA, R. M. D.; RUGGIERO, C.; LEMOS, E. D. M.; GRILI, G. V. G.; GONÇALVES, M. M.; CHAGAS, E. A. WICKERT, E. Diversidade genética em maracujazeiro-amarelo utilizando marcadores moleculares AFLP. Revista Brasileira de Fruticultura, v. 26, n. 3, p. 494-498, 2004.

HAMAKER, B. R.; VALLES, C.; GILMAN, R.; HARDMEIER, R. M.; CLARK, D.; GARCIA, H. H.; GONZALES, A. E.; KOHLSTAD, I.; CASTRO, M.; VALDIVIA, R.; RODRIGUEZ, T.; LESCANO, M. Amino acid and fatty acid profiles of the Inca Peanut (Plukenetia Volubilis). Cereal Chemistry, v. 69, n. 4, p. 461-463, 1992.

KARDOLUS, J. P.; ECK, H. J. V.; BERG, R. G. V. D. The potential of AFLP in biosystematics: a first application in Solanum taxonomy. Plant Systematics and Evolution, v. 2, n. 1, p. 87-103, 1998.

KRIVANKOVA, B.; CEPKOVA, P. H.; OCELAK, M.; JUTON, G.; BECHYNE, M.; LOJKA, B. Preliminary study of diversity of Plukenetia volubilis Based on the morphological and genetic characteristics. Agricultura Tropica et Subtropica v. 45, n. 1, p. 140-146, 2012.

NICK, C.; CARVALHO, S. P.; JESUS, A. M. S.; CUSTÓDIO, T. N.; MARIM, B. G.; ASSIS, L. H. B. Divergência genética entre acessos de mandioca. Bragantia, v. 69, n. 2, p. 289-298, 2010.

NOVELLO, D.; FRANCESCHINI, P.; QUINTILIANO, D. A. A importância dos ácidos graxos ômega-3 e ômega-6 para a prevenção de doenças e na saúde humana. Revista Salus, v. 2, n. 1, p. 77-87, 2010.

Publicado
2014-02-25
Seção
Artigos Científicos