Transferability of microsatellite markers to study the genetic diversity of the copaiba

Moisés Teixeira Rolim  Rolim; Rayssa Gomes Vasconcelos   Vasconcelos; Antonio Saulo Cunha-Machado; Jacqueline da Silva Batista Batista; Paulo de Tarso Barbosa Sampaio  Sampaio; Raquel da Silva Medeiros  Medeiros

Rolim Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Programa de Pós-Graduação em Ciências de Florestas Tropicais (PPG-CFT), Av. André Araújo, 2936, 66.067-375, Manaus, Amazonas, Brasil. https://orcid.org/0000-0003-2544-4866
Rayssa Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Programa de Pós-Graduação em Ciências de Florestas Tropicais (PPG-CFT), Av. André Araújo, 2936, 66.067-375, Manaus, Amazonas, Brasil. https://orcid.org/0000-0002-8600-4656
Antonio Saulo Cunha-Machado Centro de Biotecnologia da Amazônia
Jacqueline Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Coordenação de Biodiversidade (COBIO), Laboratório Temático de Biologia Molecular (LTBM), Av. André Araújo, 2936, 66.067-375, Manaus, Amazonas, Brasil. https://orcid.org/0000-0002-6649-6200
Paulo Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Laboratório de Silvicultura e Tecnologias Digitais (LASTED), Av. André Araújo, 2936, 66.067-375, Manaus, Amazonas, Brasil. https://orcid.org/0000-0003-0254-7651
Raquel Instituto Nacional de Pesquisas da Amazônia (INPA), Laboratório de Silvicultura e Tecnologias Digitais (LASTED), Av. André Araújo, 2936, 66.067-375, Manaus, Amazonas, Brasil. https://orcid.org/0000-0002-7411-2879

Palavras-chave: heterologous amplifications, Copaifera multijuga Hayne, polymorphism

Resumo

A copaíba (Copaifera multijuga Hayne) é a espécie do gênero mais abundante na Amazônia Central. Seu oleorresina possui elevada importância ecológica e socioeconômica para os povos tradicionais, destacando-se como um dos um dos principais Produtos Florestais Não Madeireiros (PFNM) comercializados na região. Contudo, o acesso à diversidade genética de C. multijuga é dificultado pela ausência de marcadores microssatélites específicos para a espécie. Neste sentido, este estudo teve como objetivo avaliar a transferibilidade de oito locos microssatélites da copaíba-do-cerrado (Copaifera langsdorffii Desf.) para C. multijuga. Foram amostradas 27 árvores em população natural na Reserva Florestal Adolpho Ducke, Manaus, Amazonas. A extração de DNA foi realizada de aproximadamente 120 mg de folhas, conforme método de extração de tecidos vegetais CTAB (Brometo de Cetiltrimetilamônio), com adaptações. O protocolo de amplificação utilizado foi adaptado do proposto para C. langsdorffii. Seis locos microssatélites foram amplificados e caracterizados com sucesso para C. multijuga. A análise dos genótipos revelou um total de 39 alelos, com média de 6,5 por loco. A heterozigosidade esperada média foi de 0,692. O índice de Conteúdo Informativo de Polimorfismo (PIC) revelou níveis relevantes para todos os locos utilizados (> 50%), exceto para o CL02 (48%). Apenas o loco CL01 apresentou baixo nível de heterozigotos. Esses marcadores, caracterizados pela primeira vez para C. multijuga, representam uma ferramenta valiosa para estratégias de manejo e estudos futuros de sistema reprodutivo e genética populacional desta espécie.

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